Στην κλήρωση των «16» δεν υπήρξε ντέρμπι, αφού οι Big-5 έπεσαν οι τρεις με ομάδες της Superleague και οι δύο με ομάδες από την δεύτερη τη τάξει κατηγορία. Ο Ολυμπιακός κληρώθηκε με τον Ατρόμητο, ο Παναθηναϊκός με τον Βόλο και ο Άρης με τον Λεβαδειακό ενώ οι ΑΕΚ και ΠΑΟΚ έπεσαν με Κηφισιά και Καλαμάτα αντίστοιχα.
Στα ημιτελικά ο Παναθηναϊκός και ο ΠΑΟΚ ήταν οι τυχεροί της κλήρωσης, αφού το υψηλότερο εμπόδιο που αναμένεται να αντιμετωπίσουν αν φτάσουν μέχρι εκεί είναι η Λαμία. Αντίθετα όποιος «επιβιώσει» από το Ολυμπιακός – Άρης θα βρει μπροστά του την ΑΕΚ στα ημιτελικά.
Κλήρωση 6ης φάσης (Φάση των «16»):
Ολυμπιακός – Ατρόμητος
Πανσερραϊκός – Απόλλων Πόντου
Παναθηναϊκός – Βόλος
Λαμία – Καλλιθέα
Λεβαδειακός – Άρης
Κηφισιά – ΑΕΚ
