Στις επτά φορές που συναντήθηκαν σε ημιτελικά, ο ΠΑΟΚ έχει πέντε προκρίσεις και η ΑΕΚ δύο. Στις δύο περιπτώσεις που κληρώθηκαν στα προημιτελικά έχουν από μία πρόκριση και στις επτά φορές που έπαιξαν στη φάση των «16», ο ΠΑΟΚ κυριαρχεί με πέντε προκρίσεις.
Από το 2011, όταν η ΑΕΚ είχε αποκλείσει τον ΠΑΟΚ στην ημιτελική φάση, η ομάδα της Θεσσαλονίκης έχει κυριαρχήσει: κέρδισε τρεις τελικούς και έχει τρεις προκρίσεις σε βάρος της ΑΕΚ.
Συνολικά σε τελικούς: ΠΑΟΚ – ΑΕΚ 3-3
Συνολικές προκρίσεις: ΠΑΟΚ – ΑΕΚ 11-5
Όλες οι συναντήσεις τους:
1931-32, ημιτελικά (πέρασε η ΑΕΚ)
18.10.1931: ΑΕΚ – ΠΑΟΚ 2-1 (50′ Μούγκρας, 55′ Ηλιάσκος – 75′ Παπαϊορδανίδης)
1938-39, τελικός (νικήτρια η ΑΕΚ)
28.05.1939: ΑΕΚ – ΠΑΟΚ 2-1 (41′ Χατζησταυρίδης, 73′ Μανέτας-Λάππας – 33′ Ιωαννίδης-Αποστόλου)
1963-64, φάση “16” (πέρασε η ΑΕΚ)
